酒液颜色变化
自制葡萄酒在储存过程中，可能会因为微生物活动导致颜色改变。这种情况通常出现在酵母和酶活性过高的情况下。当这些微生物开始分解糖类时，它们产生的产物可以使得葡萄酒变得更加浓郁或出现不适当的红棕色、绿色甚至黄色的现象。为了避免这一问题，可以确保在发酵前后对装满新鲜果汁或清理了所有残留物质的容器进行充分地消毒，并且定期检查瓶塞是否完好无损，以防止外界污染。
气味异常
另一种可能的问题是自制葡萄酒发出异常气味，这可能是由于未经正确处理和储存造成的。在发酵过程中，如果没有恰当控制温度、pH值以及氧气流动，那么可能会引起一系列不寻常的化学反应，从而影响最终产品的风味。此外，过度曝露于光线或者使用有机溶剂也容易导致口感上的差异。为了解决这个问题，需要严格遵循传统制作方法并采取必要措施来减少外界干扰。
沉淀生成
在某些情况下，自制葡萄酒中的沉淀生成会成为一个难题。这通常发生在原料提取不足或者添加了过多的一些成分（如蛋白质）的时候。一旦形成沉淀，就很难彻底去除，因为它往往固定在玻璃壁面上，不易浮动到瓶内。如果这种情况发生，可以尝试重新倒入透明塑料瓶，然后轻柔摇晃以帮助混合，但如果问题依旧存在，最好的办法还是从头再来一次。
酸度失衡
酸度失衡也是一个潜在的问题，当醋酸含量超过最佳范围时，将直接影响口感，使得整体感觉非常酸涩。而对于那些想要制作更甜型饮品的人来说，则需要关注糖分含量以达到理想水平。在监测和调整期间，要注意每次小幅度改动，以免一次性的大幅变化破坏整个发酵环境。
二次发酵错误
二次发酵是指将还未完全转化为乙醇的大部分果汁放回尚未完全完成初级发酿的小批量曲霉菌培养物中继续进行延长时间的小规模转化过程。但如果这项操作执行不当，比如等待时间太短或者曲霉菌数量不足，即便经过二次发酵，也无法达到最佳效果。此外，在二次发酿结束后应立即冷却至接近冰点以停止一切生化活动，而不是让其自然降温，这样可以最大限度地保护所需营养素，同时避免任何形式的氧化作用进程。