最古老的药酒配方与古代中药方剂一样，缺乏明确的名称。在马王堆出土的帛书中记载的药酒配方，同样没有特定的命名。这种情况在唐代的医书中仍然常见，如《千金要方·脾脏下》中的“治下痢绞痛肠滑不可差方”，以及《外台秘要》卷十五中的“疗风痹瘾疹方”。最早出现明确名称的是先秦及汉代，如《内经》中的“鸡矢醴”和《金匮要略》中的“红兰花酒”，多以单味药或主要成分作为名称，这种命名方式后来成为重要传统。随着时间推移，药酒命名方法变得更加多样化，可以归纳为以下几种类型：1. 以单一草本制成并以其名字命名，如羌活酒。2. 由两味草本组合制成，用这两味草本联名，如五倍子白矾酒。3. 多味草本混合制成，以其中的一至二种主导性草本作为名称，或采用简洁易记的手法如五蛇酒、五精酒等。4. 以人的名字来命名，如仓公酒、史国公酒等，以纪念之意。此外，还有结合人名与草本或功效共同使用如崔氏地黄酒、周公百岁酒等5. 以功能或治疗目标为基础命名，如安胎当归wine、愈风wine、红颜wine等6. 直接将中医方剂和 草本名称用于称呼如八珍wine和十全大补wine。此外，还有一些从不同角度进行命名前缀如白medicine wine, jade liquid wine, purple wine, earthy wine, divine medicine wine 等数量不多，不一一列举。
至于现代分类，中国传统医学界采用了新的分类体系，将所有这些古老而神奇的饮品分成了保健类、中类（内科）、外科类（妇产科）、儿童科、小儿科骨伤科皮肤病专门治疗各个方面，其中还包括了口腔疾病专门处理。这是因为中国历史悠久，它们既保持了传统，也融入了现代科技，使得它们既适应古代，又符合现在的人们需求。在这个过程中，由于长期发展，有许多不同的用途，比起过去更为广泛，从古代疾病到现代慢性病都有所涵盖，这是一个巨大的工作内容需要不断探索与完善。