在一个风和日丽的春日，名侦探柯南与他的助手小五郎一起接受了一个特殊的邀请——去一家位于郊区的小别墅参加一个龙舌兰爱好者的聚会。聚会上，每个人都看似平静，但实际上隐藏着复杂的情感纠葛。
第一个发现的是主办方——丰田先生，他自称是龙舌兰种植大师，却对自己的植物知识显得过于自信，让人怀疑他是否真的懂得如何照顾这些珍贵的植物。丰田先生不仅精通种植，还声称自己有几百种独特品种，这让其他参会者对他的话语充满了敬畏。
第二个发现是来自上海的一位女士，她对龙舌兰有着极其深厚的感情，不仅拥有多部关于龙舌兰的大型图书，还常年在国外追逐各种稀有的品种。但她却总是在提到某个叫做“黑暗之花”的传说中品種，它据说能够治愈一切病痛，引起了所有人的兴趣。
第三个发现是富豪张氏，他以其慷慨而闻名，但也有人认为他只是想通过捐赠来提升自己的社会形象。张氏竟然宣布，在聚会结束后，将出资购买一片土地，用来建立一座纪念性质的大型龙舌兰园。
第四个发现则是一个神秘人物，他们似乎总是在观察每一个人动作，每当有人提及“黑暗之花”时，就立刻离场。在这背后的目的究竟是什么？
第五点，经过仔细调查，人们开始怀疑丰田、上海女士和张氏之间存在着什么联系。他们三人曾经共同参与了一次大型国际植物展览，并且有消息指出，那时候发生了一件重大争议事件，对他们三个来说都是沉重的心结。
最后，小五郎偶然间找到了一条重要线索，是来自那位神秘人物留下的笔记本中的信息。他在笔记本里写下了“黑暗之花”的确切位置，也就是说，这整个事件并非简单的聚会，而是一场精心策划的手段，以此来寻找真正价值无价的地球上的宝藏之一——那被誉为能治愈一切病痛的地球上唯一的一株“黑暗之花”。
最终，在一次紧张刺激的情节中，小五郎和名侦探柯南揭开了这一切背后的真相：原来，“黑暗之花”并不存在，它只是一场局促演练，旨在考验那些真正关心这类事物的人们。而这个局面背后，是为了保护一种被认为可能具有医疗作用的地球上极为罕见植物，从而避免它落入错误的手中。这次冒险虽然没有解开任何谜团，但却展示了名侦探柯南及其助手小五郎所拥有的卓越洞察力以及坚韧不拔的心志。