在一个风和日丽的午后，名侦探柯南与他的助手小五郎、毛利兰以及少年侦探团成员们一起踏上了前往乡间别墅的旅程。目的地是一位古董收藏家老先生的豪宅，这里传说中藏有一批珍贵而罕见的植物，其中就有那闻名遐迩的龙舌兰。

一到达别墅，大家便被其精致美观的大门吸引。别墅内布满了各式各样的古董，但最让人印象深刻的是那座专为龙舌兰种植的小花园。花园里的每一株龙舌兰都经过精心培育，每一种品种都有着独特的情趣和历史背景。老先生热情地向他们展示着这些珍稀植物，并邀请他们参与一次特别任务——寻找失踪的一瓶极其稀有的“蓝色天空”系列龙舌兰。

柯南敏锐地注意到这次寻找并非简单之事，而是隐藏着一段复杂的人物关系和背后的阴谋。他决定亲自介入调查。在查看现场时，他发现了一些不自然的地面压痕，以及一些看似随意放置却又细致安排好的暗示线索。

通过仔细分析这些线索，柯南逐渐揭开了真相。一开始，那瓶“蓝色天空”系列龙舌兰确实存在于花园中，但随后它不知为何消失了。而这个过程中，不少人物似乎都对这件事颇感兴趣，有人甚至愿意为了获得这瓶稀有的植物而采取任何手段。

最终，在一次紧张刺激的追捕行动之后，柯南成功找回了那瓶“蓝色天空”的龍竹蘭，并且还揭露了幕后的真相原来是一位私下研究生物学的人类变异者，他们利用科学技术制造出了一种可以控制人类思想的药剂，以此来获取更大的权力。但就在他们即将得逞的时候，被柯南及时阻止。

案件解决后，一切平静下来，小五郎等人也由衷赞扬了柯南智慧过人的神通广大。在离开豪宅之前，他们再次走进那个充满奇妙气息的小花园，那些庄严而优雅的龍竹蘭仿佛在用它们高傲的声音告诉世间，无论世界多么复杂，只要勇敢的心灵总能找到正确之路。