在一个宁静的傍晚，名侦探柯南和他的助手小五郎正在一家著名的龙舌兰酒吧里享受着他们专属的秘制龙舌兰鸡尾酒。这个特殊的地方不仅因为其独特风味而闻名遐迩，更因为这里藏匿着一段古老传说——据说每一次品尝这款鸡尾酒，就像是穿越回那个充满神秘与危险的小镇。
故事讲述的是一个关于毒药、谜团和惊险的一夜。在这个微妙平衡的世界中，每一种花卉都有其独特的用途，而龙舌兰更是被认为具有极强的药性。因此，当一位富有的商人邀请柯南来解决他家的珍贵龙舌兰种植园中的奇怪事件时，柯南并未犹豫，他知道这是一个需要细致分析、精准推理的问题。
当他们抵达那片郁郁葱葱的大地时，发现了多处疑似的毒害迹象——一些植物死去，有些甚至出现了异常生长。而最让人震惊的是，一只装有珍贵龙舌兰种子的小瓶子竟然被盗走了。这一切似乎都指向了一场更加深远的阴谋：有人试图通过利用这些稀有植物来控制整个市场，从而获得巨大的经济利益。
柯南仔细观察周围环境，不忘提醒小五郎注意任何可能的小细节。他开始逐步排除嫌疑人，并将注意力聚焦于那些看似无关紧要的人物上。一番艰苦卓绝的情报搜集后，他们终于找到了线索，那是一张被遗忘在角落里的旧照片，其中有一位曾经涉足过此地，但现在已经失踪多年的研究者。
经过一系列精心布置的心理战术，最终揭露出了真相：失踪研究者的儿子，在父母离世后继承了一大笔财产，却无法处理父亲留下的复杂遗产问题。当他得知自己的父亲留下了一份对家族来说极为重要但又难以解读的手稿时，他决定采取极端行动，以确保自己能得到所有权利，即使这意味着必须销毁所有竞争者所拥有的证据和材料。
案件解决之后，小镇上的居民们再次重燃希望之光。虽然那些宝贵的地球上的花朵仍然存在威胁，但正如那杯由“龙舌兰”命名的鸡尾酒一样，这个地方依然值得人们继续探索，因为这里隐藏着更多未知领域等待发掘。而对于柯南来说，无论是面对什么样的挑战，都不会阻挡他追求真相、维护公正的一往无前。