最古老的药酒配方与古代中药方剂一样，往昔无名。马王堆出土的帛书记载的药酒秘方，只有形容，没有名字。在唐代方书中，如《千金要方·脾脏下》所述“治下痢绞痛肠滑不可差方”，以及《外台秘要》卷十五中的“疗风痹瘾疹方”，这样的未命名情况在那时仍旧普遍存在。而最早的药酒被赋予名称，则见于先秦及汉代，如《内经》中的“鸡矢醴”和《金匮要略》中的“红兰花酒”。这些单味药或一份主药作为名称，被后世广为传承。
随着时间的推移，汉代以后，命名方法日渐丰富。传统之法，可归纳为五种：首以单味配制而成，以其名冠之，如羌活酒；其次二味并用，一体命名，如五倍子白矾酒；再者，用一二主品为基，取其简易可记，如羌独活酒，或采用概括性质易于铭记如五蛇、五精、五枝等；又有人称以尊贵者命，即仓公、史国公等，其意在纪念；有则人称加功效联用，比如崔氏地黄酒、周公百岁酒等。此外，还有一些以功能主治为依据命名，如安胎当归酒、愈风佳酿等，这类别居多数。
此外，又有一些直接沿袭中医处方和名称如八珍大补良品或十全大补佳酿，不同角度下的命名也有代表性作品如白衣仙醉青囊妙液玉液春光诸般奇珍异宝。至于本草纲目所列69种能治疾病之物，每一种均选用黄色米 酒浸泡制成，其中包括米 酒通血脉润皮肤散湿气除风下气解毒消毒各具特色。
中国古籍医学界遵循两大体系——医术与自然科学相结合——对所有这些而言都能接受，并将它们分门别类，将保健内科妇科儿科骨伤皮肤口齿及其他领域进行分类整理，使得它既保持了传统文化也融入了现代科技进步。但由于历史悠久，每一种配料不仅包含过去已知疾病，而且涵盖了现代医学概念，因此内容极为丰富，对未来研究发展充满巨大的潜力。