最古老的药酒配方与古代中药方剂一样，没有固定的名称。在马王堆出土的帛书中记载的药酒配方，同样缺乏具体的名称。这种情况在唐代时期出版的医学著作中仍然常见，如《千金要方·脾胃疾病》中的“治下痢疾绞痛肠道泄泻难以治疗之方”，以及《外台秘要》的“疗风寒湿痹瘙疹之方”。最早出现命名的一种药酒，可以追溯到先秦和汉朝，如《内经》中的“鸡矢醴”和《金匮要略》中的“红兰花酒”，多以单一草本或制成品中主体成分作为名字，这种命名方式后世广为流传。随着时间的推移，药酒命名方法变得更加多样化。传统上的命名手法主要包括以下几种：1. 单味草本制成的药酒，以其名称作为标识；2. 两味草本配合制成，通常将两者并列于一处；3. 多味草本混合制成，用其中一种或几种关键原料作为名字，或采用简洁易记的手法进行命名，如五蛇、五精、五枝等；4. 以人名来命名某些藥酒，以纪念某位人物；5. 根据功效来定夺如安胎当归酒、愈风雨伤筋骨等。此外，还有一些从不同角度进行选择，并直接使用其功能或作用来命名如八珍大补良等。此类类型在传统上占有相当的地位。
至于现代分类标准，《本草纲目》详细记录了69款可用于治疗疾病的藥酒，其中每款均采用黄色米醇制作而成，有如下用途：米醇具有行气通血脉、润皮肤散湿气、除风降气解毒及桐油毒特性。而其他一些藥物也有各自独特功能，如枸杞子可以补虚弱益精髓去冷风壮阳道止目泪健腰脚。
中国藥物虽同时兼具饮品与医疗元素，现在学术界已经能接受这两种理论体系相结合的大科分类法，将她分为保健内科外妇儿科骨伤皮肤耳鼻喉口齿等六个领域。这不仅保持了中國傳統藥物文化，又因科学发展展现出了新面貌。然而，由於這種醫療實踐歷經數千年演變，其內容既涵蓋了過去兩千年的醫學知識，也包括現代醫學術語，因此後人對她的整理與發展是一項巨大的挑戰。
